纳米孔三代测序系统
仪器编号
ZY2023000108
规格
GridION Mk1+PromethION 2 Solo
生产厂家
Nanopore Technologies
型号
GridION Mk1+PromethION 2 Solo
制造国家
英国
购置日期
2022-06-20
放置地点
科学楼北楼 108测序室
出厂日期
2023-04-17

主要规格及技术指标

1.起始样品量:10pg~5ug。
2.测序样品上样量:体积≤75ul、核酸量≥50ng。
3.检测核酸类型:样品原始DNA或RNA,以及cDNA及PCR产物等。
4.测序速度:≥450bp/s(DNA)、≥70bp/s(RNA)。
5.运行时间:10min~72hrs(可控);可以按照需要数据量进行测序。
6.运行数:GridION Mk1有5个独立的芯片槽,PromethION 2 Solo部分2个独立芯片槽,可进行1~7个独立的实验。
7.文库制备时间:10min~2hrs。
8.获取序列时间:运行≥2min、实时。
9.读长长度:测序长度为模板长度,长度范围200bp-4Mb。
10.单张芯片产出不低于100G数据量,30~150 Gb/run(30 Gb/flow cell)。
11.碱基质量:正确率99%以上。
12.碱基修饰:直接检测DNA或RNA碱基修饰信息(甲基化检测),不需要其他实验。
13.按需检测:按需测序,单独芯片或同时运行多张芯片

主要附件及配置

主要功能及特色

1.应用广泛:全基因组测序、靶向测序、RNA测序、宏基因组测序、表型研究等。样本类型包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组以及各种临床标本的DNA和RNA;
2.测序起始量需求从pg级到ug级都可以进行建库;
3.使用简便:仪器插电就可使用,没有复杂的激光或光路系统,无需日常维护;
4.对实验环境要求低,建库方法简便快捷,人员配置灵活,适用于实验室或现场条件;
5.实时数据:提供最先进的单分子实时测序,上机后2分钟产生碱基序列数据。并可以根据实验需求设置测序反应时间,可选范围在几分钟到48小时之间;
6.单分子测序:支持直接原始DNA/RNA测序,无需PCR扩增,免除PCR扩增带来的错误和GC偏差,并保留修饰信息;
7.全长转录本测序:一条Reads可跨越全长转录本,无需拼接、不因引物设计丢失片段两端碱基数据;
8.按需测序:10~30 Gb/flow cell,支持多样本混样上机,支持测序随时停止、清洗芯片重复使用;
9.直接RNA测序:提取RNA无需逆转录成cDNA即可进行测序;
10.甲基化检测:碱基修饰基于电信号的差异检测碱基,在DNA/RNA测序同时可直接检测碱基修饰;
11.分析软件丰富:数据分析工作站预先安装了30多种可用于分析Nanopore测序数据的常用工具;
12.集成设备:仪器本身为高性能计算机,可用于数据获取,原始数据存储以及碱基转换(basecalling)。集成高性能数据处理减少了对复杂IT基础设施的需要。

公告名称 公告内容 发布日期

100元/小时。